Sistemi TIMS ka shfaqur sërish probleme në Shqipëri. Më konkretisht në pikat e kalimit kufitar të Gorricës dhe Qafë Thanës, të cilat lidhin Republikën e Shqipërisë dhe Maqedoninë e Veriut, po punohet me regjistra manualë dhe jo sistem teknologjik.
Kjo pasi TIMS ka dalë jashtë kontrollit. Në Qafë Thanë sistemi herë pas here ka probleme, ç’ka ka detyruar punonjësit e pikës kufitare të funksionojnë me regjistra manual. Në Gorricë kjo procedurë por ndiqet që prej mëngjesit të sotëm. Këto problematika rikthejnë sulmin e hakerave në vendin tonë, pas të cilëve është deklaruar se fshihen iranianët.